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Compétence

RDKit Cheminformatics

Guide RDKit pour molécules, descripteurs et sous-structures

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Installation

Scripts inclus
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Se déclenche pour

Cheminformatics work needing direct RDKit control: molecular I/O, descriptors, fingerprints, reactions, conformers.

Outils requis
ReadWriteEditBash
Auteur
K-Dense Inc.
Licence
BSD-3-Clause

Couvre les fonctions détaillées de RDKit — assainissement manuel, ensembles de descripteurs personnalisés, gestion des réactions et génération de coordonnées 2D et 3D — plutôt que les interfaces simplifiées qui le surplombent. Douze domaines fonctionnels sont accompagnés d’exemples de code, de la lecture de fichiers SMILES et SDF à la recherche par similarité. Les notes d’installation déconseillent de mélanger les distributions conda-forge et PyPI dans un même environnement.

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