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Skill

RDKit Cheminformatics

Guida RDKit per molecole, descrittori e ricerca strutturale

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Installazione

Include script
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Si attiva con

Cheminformatics work needing direct RDKit control: molecular I/O, descriptors, fingerprints, reactions, conformers.

Richiede strumenti
ReadWriteEditBash
Autore
K-Dense Inc.
Licenza
BSD-3-Clause

Copre gli aspetti dettagliati di RDKit, tra cui sanitizzazione manuale, set personalizzati di descrittori, gestione delle reazioni e generazione di coordinate 2D e 3D, invece dei wrapper semplificati costruiti sopra la libreria. Include esempi di codice per dodici aree funzionali, dalla lettura di SMILES e SDF alla ricerca per similarità. Le note di installazione sconsigliano di combinare nello stesso ambiente le build di conda-forge e PyPI.

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