BioMCP

uv tool install biomcp-cli

{
  "mcpServers": {
    "biomcp": {
      "command": "uv",
      "args": [
        "tool",
        "install",
        "biomcp-cli"
      ]
    }
  }
}

BioMCP vereinheitlicht die unterschiedlichen Abfragesprachen biomedizinischer Register zu einer gemeinsamen Such- und Abrufsyntax für Gene, Varianten, Artikel, Studien, Medikamente, Krankheiten, Signalwege, Proteine, Nebenwirkungen und weitere Entitäten. Dahinter stehen unter anderem MyVariant.info, ClinVar, gnomAD, CIViC, OncoKB, ClinicalTrials.gov v2, PubTator3, Europe PMC, OpenTargets, ChEMBL, UniProt und AlphaFold, sodass sich etwa eine Variante von der Populationshäufigkeit über ihre klinische Bedeutung bis zu offenen Studien verfolgen lässt. Das PyPI-Paket heißt biomcp-cli, nicht biomcp; stdio wird mit biomcp serve und streambares HTTP mit biomcp serve-http gestartet.