BioMCP

uv tool install biomcp-cli

{
  "mcpServers": {
    "biomcp": {
      "command": "uv",
      "args": [
        "tool",
        "install",
        "biomcp-cli"
      ]
    }
  }
}

Biyomedikal veri her biri kendi sorgu diliyle gelen onlarca kayıt sistemine dağılmış durumda; BioMCP bunu varlık türleri üzerinde tek bir search ve get grameri altında topluyor: gen, varyant, makale, deneme, ilaç, hastalık, yolak, protein, advers olay ve devamı. Bu varlıkların arkasında MyVariant.info, ClinVar, gnomAD, CIViC, OncoKB, ClinicalTrials.gov v2, PubTator3, Europe PMC, OpenTargets, ChEMBL, UniProt ve AlphaFold gibi kaynaklar duruyor; dolayısıyla bir varyant sorusu popülasyon sıklığından klinik anlamlılığa, oradan açık denemelere kadar her adımda yeni bir API öğrenmeden yürüyebiliyor. Projenin kendi belgelediği bir paketleme tuzağı var: PyPI dağıtımının adı biomcp değil biomcp-cli. Sunucu biomcp serve ile stdio, biomcp serve-http ile streamable HTTP konuşuyor.