BioMCP

uv tool install biomcp-cli

{
  "mcpServers": {
    "biomcp": {
      "command": "uv",
      "args": [
        "tool",
        "install",
        "biomcp-cli"
      ]
    }
  }
}

BioMCP brengt verspreide biomedische registers samen in één zoek- en ophaalsyntaxis voor entiteiten zoals genen, varianten, artikelen, onderzoeken, geneesmiddelen, ziekten, routes, eiwitten en bijwerkingen. Het verbindt onder meer MyVariant.info, ClinVar, gnomAD, CIViC, OncoKB, ClinicalTrials.gov v2, PubTator3, Europe PMC, OpenTargets, ChEMBL, UniProt en AlphaFold, zodat een variant kan worden gevolgd van populatiefrequentie tot klinische betekenis en openstaande onderzoeken. De PyPI-distributie heet biomcp-cli, niet biomcp, en biedt stdio via biomcp serve en streambare HTTP via biomcp serve-http.