BioMCP

uv tool install biomcp-cli

{
  "mcpServers": {
    "biomcp": {
      "command": "uv",
      "args": [
        "tool",
        "install",
        "biomcp-cli"
      ]
    }
  }
}

BioMCP ujednolica wyszukiwanie i pobieranie danych z dziesiątek rejestrów dla takich encji jak geny, warianty, artykuły, badania, leki, choroby, szlaki, białka i zdarzenia niepożądane. Korzysta między innymi z MyVariant.info, ClinVar, gnomAD, CIViC, OncoKB, ClinicalTrials.gov v2, PubTator3, Europe PMC, OpenTargets, ChEMBL, UniProt i AlphaFold, dzięki czemu jedno pytanie o wariant może połączyć częstość populacyjną, znaczenie kliniczne i otwarte badania. Pakiet w PyPI nazywa się biomcp-cli, nie biomcp; tryb stdio uruchamia polecenie biomcp serve, a strumieniowe HTTP — biomcp serve-http.