BioMCP

uv tool install biomcp-cli

{
  "mcpServers": {
    "biomcp": {
      "command": "uv",
      "args": [
        "tool",
        "install",
        "biomcp-cli"
      ]
    }
  }
}

BioMCP unifie la recherche et la consultation dans des dizaines de registres biomédicaux pour les gènes, variants, articles, essais, médicaments, maladies, voies biologiques, protéines, événements indésirables et autres entités. Il s’appuie notamment sur MyVariant.info, ClinVar, gnomAD, CIViC, OncoKB, ClinicalTrials.gov v2, PubTator3, Europe PMC, OpenTargets, ChEMBL, UniProt et AlphaFold, ce qui permet de passer de la fréquence d’un variant à sa portée clinique puis aux essais ouverts sans changer d’API. Le paquet PyPI s’appelle biomcp-cli, et le service fonctionne en stdio avec biomcp serve ou en HTTP diffusable avec biomcp serve-http.