Skill
AnnData
De h5ad-datastructuur onder de scverse-stack voor single-cell
GitHub-sterren
34K
Repository op GitHub
Installeren
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Wordt geactiveerd bij
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
Vereist tools
ReadWriteEditBash
- Auteur
- K-Dense Inc.
- Licentie
- BSD-3-Clause
Richt zich op de formaatlaag, niet op een analysepipeline: AnnData-objecten bouwen, h5ad en zarr lezen en schrijven, subsets maken en batches samenvoegen zonder ongemerkt de volgorde te wijzigen. Sparse matrices, backed mode en lui laden met Dask zijn beschreven voor gegevens die niet in het geheugen passen. Verouderde aanroepen zoals ad.read, AnnData.concatenate en __version__ staan naast hun vervangers, terwijl experimentele API's duidelijk als instabiel zijn gemarkeerd.
Reacties(0)
Log in om te reageren