AnnData
h5ad-datastrukturen bakom scverse för enkelcellsdata
Installera
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
- Utvecklare
- K-Dense Inc.
- Licens
- BSD-3-Clause
Detta är formatlagret snarare än en analyspipeline: det bygger AnnData-objekt, läser och skriver h5ad och zarr samt delar upp och sammanfogar batcher utan att något omordnas i det tysta. Glesa matriser, backed-läge och Dask-baserad lat inläsning dokumenteras för data som inte ryms i minnet. Föråldrade anrop som ad.read, AnnData.concatenate och __version__ visas bredvid sina ersättare, medan experimentella API:er tydligt markeras som instabila.
Liknande färdigheter
scvi-tools
FärdighetProbabilistiska enkelcellsmodeller för korrigering och integrering
Scanpy
FärdighetStandardflöde för encells-RNA-seq från QC till markörgener
SAST Configuration
FärdighetStäller in Semgrep, CodeQL och SonarQube för relevanta fynd
Kommentarer(0)
Logga in för att kommentera