AnnData
Структура h5ad в основе стека scverse для отдельных клеток
Установка
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
- Автор
- K-Dense Inc.
- Лицензия
- BSD-3-Clause
Это уровень формата данных, а не аналитический конвейер: создание объектов AnnData, чтение и запись h5ad и zarr, выбор подмножеств и объединение партий без незаметного изменения порядка. Для данных, не помещающихся в память, описаны разреженные матрицы, режим backed и отложенная загрузка на основе Dask. Устаревшие вызовы ad.read, AnnData.concatenate и __version__ приведены вместе с заменами, а экспериментальные API прямо отмечены как нестабильные.
Похожие навыки
scvi-tools
НавыкВероятностные модели для коррекции партий и интеграции клеток
Scanpy
НавыкАнализ scRNA-seq: от контроля качества до маркерных генов
SAST Configuration
НавыкНастраивает Semgrep, CodeQL и SonarQube для реальных угроз
Комментарии(0)
Войдите, чтобы комментировать