AnnData
Estrutura h5ad usada pela coleção scverse para célula única
Instalação
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licença
- BSD-3-Clause
É uma camada de formato, não um pipeline de análise: cria objetos AnnData, lê e grava h5ad e zarr, seleciona subconjuntos e combina lotes sem alterar silenciosamente a ordem dos dados. Documenta matrizes esparsas, modo backed e carregamento tardio com Dask para conjuntos que não cabem na memória. Chamadas obsoletas como ad.read, AnnData.concatenate e __version__ aparecem ao lado de suas substitutas, enquanto APIs experimentais são identificadas como instáveis.
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