Skill
AnnData
La struttura h5ad alla base dell'ecosistema scverse
Stelle su GitHub
34K
Repository su GitHub
Installazione
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Si attiva con
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
Richiede strumenti
ReadWriteEditBash
- Autore
- K-Dense Inc.
- Licenza
- BSD-3-Clause
Gestisce il livello del formato, non la pipeline di analisi: creazione di oggetti AnnData, lettura e scrittura di h5ad e zarr, selezione di sottoinsiemi e concatenazione di batch senza riordinamenti impliciti. Documenta matrici sparse, modalità backed e caricamento differito basato su Dask per dati che non entrano in memoria. Le chiamate deprecate come ad.read, AnnData.concatenate e __version__ sono affiancate dalle relative sostituzioni, mentre le API sperimentali vengono indicate chiaramente come instabili.
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