AnnData
Structura h5ad de la baza ecosistemului unicelular scverse
Instalare
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licență
- BSD-3-Clause
Este stratul de format, nu un flux de analiză: creează obiecte AnnData, citește și scrie h5ad și zarr, selectează subseturi și concatenează loturi fără reordonări neobservate. Matricele rare, modul backed și încărcarea întârziată bazată pe Dask sunt documentate pentru seturile de date care nu încap în memorie. Apelurile învechite precum ad.read, AnnData.concatenate și __version__ sunt prezentate alături de înlocuitorii lor, iar API-urile experimentale sunt marcate drept instabile.
Skill-uri similare
scvi-tools
SkillModele unicelulare probabilistice pentru integrarea loturilor
Scanpy
SkillFlux RNA-seq unicelular: de la QC la clustere și gene marker
SAST Configuration
SkillConfigurează Semgrep, CodeQL și SonarQube pentru constatări reale
Comentarii(0)
Autentifică-te pentru a comenta