Umiejętność

AnnData

Struktura danych h5ad dla ekosystemu scverse

Gwiazdki na GitHubie

34 tys.

Repozytorium na GitHubie

Instalacja

gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata

Uruchamia się przy

Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.

Wymaga narzędzi

ReadWriteEditBash

Autor: K-Dense Inc.
Licencja: BSD-3-Clause

Repozytoriumhttps://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

To warstwa formatu, a nie potok analityczny: tworzenie obiektów AnnData, odczyt i zapis h5ad oraz zarr, wybieranie podzbiorów i łączenie partii bez niezauważalnej zmiany kolejności. Macierze rzadkie, tryb backed i leniwe ładowanie oparte na Dask są opisane z myślą o danych, które nie mieszczą się w pamięci. Wycofane wywołania, takie jak ad.read, AnnData.concatenate i __version__, są wymienione obok ich zamienników, a eksperymentalne API oznaczono jako niestabilne, zamiast bez zastrzeżeń je zalecać.

Komentarze(0)

Zaloguj się, aby skomentować

Nie ma jeszcze komentarzy — napisz pierwszy.

Podobne umiejętności

Scanpy

Umiejętność

Standardowa analiza scRNA-seq od QC po klastry i geny markerowe

Bazy danych i daneBadania i nauki