AnnData
Struktura danych h5ad dla ekosystemu scverse
Instalacja
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills anndata
Creating, reading or writing h5ad and zarr objects, subsetting or concatenating single-cell datasets, or working in backed mode on large matrices.
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licencja
- BSD-3-Clause
To warstwa formatu, a nie potok analityczny: tworzenie obiektów AnnData, odczyt i zapis h5ad oraz zarr, wybieranie podzbiorów i łączenie partii bez niezauważalnej zmiany kolejności. Macierze rzadkie, tryb backed i leniwe ładowanie oparte na Dask są opisane z myślą o danych, które nie mieszczą się w pamięci. Wycofane wywołania, takie jak ad.read, AnnData.concatenate i __version__, są wymienione obok ich zamienników, a eksperymentalne API oznaczono jako niestabilne, zamiast bez zastrzeżeń je zalecać.
Podobne umiejętności
scvi-tools
UmiejętnośćModele probabilistyczne do korekcji partii i integracji
Scanpy
UmiejętnośćStandardowa analiza scRNA-seq od QC po klastry i geny markerowe
SAST Configuration
UmiejętnośćKonfiguruje Semgrep, CodeQL i SonarQube pod realne zagrożenia
Komentarze(0)
Zaloguj się, aby skomentować