مهارة
Nextflow
كتابة مسارات Nextflow وnf-core وتشغيلها وتصحيحها
التثبيت
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills nextflow
تُفعّل عند
Any reproducible bioinformatics workflow work: running or debugging an nf-core pipeline, writing DSL2 modules, or configuring HPC/cloud executors.
- المؤلف
- K-Dense Inc.
- الترخيص
- Apache-2.0
يقسم العمل منذ البداية إلى مسارين: تشغيل مسار nf-core قائم وتصحيح استئناف فاشل، أو كتابة عمليات وقنوات ووحدات DSL2 من الصفر. يشمل إعداد المنفذات والحاويات التشغيل المحلي وSLURM وغيره من مجدولات HPC، إضافة إلى AWS وGoogle وAzure وKubernetes، مع استخدام المسار نفسه وملف إعداد مختلف. ويحقق قابلية إعادة الإنتاج عبر حاويات منفصلة لكل مهمة وإصدارات مثبتة للمسار والمحرك وذاكرة الاستئناف، مع اختبار الوحدات ومسارات العمل الفرعية بواسطة nf-test وفق قواعد فحص nf-core.
التعليقات(0)
سجّل الدخول للتعليق