Nextflow
Nextflow ve nf-core boru hatlarını yazar, çalıştırır ve hatalarını ayıklar.
Kurulum
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills nextflow
Any reproducible bioinformatics workflow work: running or debugging an nf-core pipeline, writing DSL2 modules, or configuring HPC/cloud executors.
- Geliştirici
- K-Dense Inc.
- Lisans
- Apache-2.0
İşi en baştan iki yola ayırıyor: hazır bir nf-core boru hattını çalıştırıp yarım kalan koşuyu ayıklamak ya da sıfırdan DSL2 süreçleri, kanalları ve modülleri yazmak. Yürütücü ve konteyner yapılandırması yerel koşuyu, SLURM ve benzeri HPC zamanlayıcılarını, AWS, Google, Azure ve Kubernetes arka uçlarını kapsıyor; boru hattı aynı kalıyor, yalnızca profil değişiyor. Yeniden üretilebilirlik somut karşılıklarıyla ele alınmış: görev başına konteyner, sabitlenmiş boru hattı sürümü, sabitlenmiş motor sürümü ve devam önbelleği. Modül ve alt akış sınamaları nf-core lint kurallarına göre nf-test ile yapılıyor.
Benzer skill'ler
GitHub Actions Templates
SkillBoş bir .github klasörü yerine çalışır durumda iş akışı dosyaları verir.
Understand Anything
SkillYazmadığınız bir kod tabanının gezilebilir haritasını çıkarır.
GitHub Actions Hardening
SkillWorkflow dosyalarını CI'ye özgü saldırı yüzeyine göre denetler.
Yorumlar(0)
Yorum yapmak için giriş yap