Biopython
Secuencias, formatos y acceso a NCBI Entrez con Biopython
Instalación
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licencia
- Biopython License Agreement
Está orientado al procesamiento por lotes y a pipelines personalizados: lectura y conversión de FASTA, GenBank, FASTQ, PDB y mmCIF, ejecución o análisis de BLAST y creación de alineamientos y árboles filogenéticos. El uso de Entrez se documenta junto con los requisitos de identificación y límites de frecuencia de NCBI. La guía se centra en Biopython 1.87, que corrigió una vulnerabilidad del analizador relevante al leer XML de Entrez procedente de fuentes no confiables.
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