Biopython
Biopython ile dizi işleme, biyolojik dosya biçimleri ve NCBI Entrez erişimi.
Kurulum
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
- Geliştirici
- K-Dense Inc.
- Lisans
- Biopython License Agreement
Toplu işleme ve kendi boru hattını kuranlar için: FASTA, GenBank, FASTQ, PDB ve mmCIF okuma-yazma, BLAST çalıştırma veya çıktısını ayrıştırma, hizalama ve filogenetik ağaç kurma. Entrez kullanımı, NCBI'nin kimlik bildirme ve istek sınırı beklentileriyle birlikte anlatılıyor. Metin Biopython 1.87 sürümüne göre yazılmış; bu sürüm güvenilmeyen kaynaktan gelen Entrez XML'i ayrıştırırken açılan bir güvenlik açığını kapatıyor.
Benzer skill'ler
pysam
SkillBAM, CRAM ve VCF dosyalarını Python'dan HTSlib üzerinden okur ve yazar.
Boltz
SkillBoltz yapı tahmini, tarama ve bağlayıcı tasarımı işlerini boltz-api komut satırı üzerinden çalıştırıyor.
pyOpenMS
SkillOpenMS ile proteomik ve metabolomik kütle spektrometrisi akışları.
Yorumlar(0)
Yorum yapmak için giriş yap