Skill
Biopython
Sequências, formatos e acesso ao NCBI Entrez com Biopython
Instalação
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Acionada por
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
Requer ferramentas
ReadWriteEditBash
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licença
- Biopython License Agreement
Destina-se a processamento em lote e pipelines personalizados: leitura e conversão de FASTA, GenBank, FASTQ, PDB e mmCIF, execução ou análise de resultados do BLAST e criação de alinhamentos e árvores filogenéticas. O uso do Entrez é documentado junto às exigências de identificação e limites de requisições impostos pelo NCBI. As orientações se destinam ao Biopython 1.87, que corrigiu uma vulnerabilidade no parser relevante para a leitura de XML do Entrez proveniente de fontes não confiáveis.
Comentários(0)
Entre para comentar