Umiejętność
Biopython
Sekwencje, formaty danych i dostęp do NCBI Entrez w Biopython
Instalacja
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Uruchamia się przy
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
Wymaga narzędzi
ReadWriteEditBash
- Autor
- K-Dense Inc.
- Licencja
- Biopython License Agreement
Jest przeznaczone do przetwarzania wsadowego i własnych potoków: odczytu i konwersji plików FASTA, GenBank, FASTQ, PDB i mmCIF, uruchamiania lub analizowania wyników BLAST oraz tworzenia dopasowań i drzew filogenetycznych. Korzystanie z Entrez opisano wraz z wymaganiami NCBI dotyczącymi identyfikacji użytkownika i limitów zapytań. Wskazówki odnoszą się do Biopython 1.87, w którym naprawiono lukę parsera istotną podczas odczytu plików XML z Entrez pochodzących z niezaufanych źródeł.
Komentarze(0)
Zaloguj się, aby skomentować