Biopython
Sequenties, bestandsformaten en NCBI Entrez via Biopython
Installeren
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
- Auteur
- K-Dense Inc.
- Licentie
- Biopython License Agreement
Gericht op batchverwerking en maatwerkpijplijnen: FASTA, GenBank, FASTQ, PDB en mmCIF lezen en converteren, BLAST uitvoeren of de resultaten verwerken en alignments en fylogenetische bomen opbouwen. Het gebruik van Entrez wordt uitgelegd samen met de identificatievereisten en snelheidslimieten die NCBI aan gebruikers oplegt. De instructies zijn bedoeld voor Biopython 1.87, waarin een kwetsbaarheid in de parser is verholpen die relevant is bij het lezen van Entrez XML uit niet-vertrouwde bronnen.
Vergelijkbare skills
pysam
SkillLeest en schrijft BAM-, CRAM- en VCF-bestanden via HTSlib
Boltz
SkillVoert Boltz-taken uit via de opdrachtregel van boltz-api
pyOpenMS
SkillMassaspectrometriepijplijnen voor proteomics en metabolomics
Reacties(0)
Log in om te reageren