Biopython
Séquences, formats biologiques et accès à NCBI Entrez avec Biopython
Installation
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Working with biological sequences, converting bioinformatics file formats, BLAST automation, or NCBI Entrez queries.
- Auteur
- K-Dense Inc.
- Licence
- Biopython License Agreement
Conçu pour les traitements par lots et les pipelines personnalisés : lecture et conversion de fichiers FASTA, GenBank, FASTQ, PDB et mmCIF, exécution ou analyse de BLAST, création d’alignements et d’arbres phylogénétiques. L’utilisation d’Entrez est documentée avec les exigences de NCBI concernant l’identification des clients et les limites de requêtes. Le guide cible Biopython 1.87, qui corrige une vulnérabilité de l’analyseur importante lors de la lecture de fichiers XML Entrez provenant de sources non fiables.
Compétences similaires
pysam
CompétenceLit et écrit des fichiers BAM, CRAM et VCF via HTSlib
Boltz
CompétencePilote les prédictions et conceptions Boltz en ligne de commande
pyOpenMS
CompétencePipelines OpenMS pour la protéomique et la métabolomique
Commentaires(0)
Connectez-vous pour commenter