مهارة

scvi-tools

نماذج احتمالية أحادية الخلية لتصحيح الدفعات ودمج البيانات

التثبيت

gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills scvi-tools

تُفعّل عند

Batch correction, transfer learning, multimodal or spatial single-cell integration, or differential expression that needs uncertainty.

المؤلف: K-Dense Inc.
الترخيص: BSD-3-Clause

المستودعhttps://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

يغطي عائلة النماذج التوليدية العميقة المبنية على PyTorch: ‏scVI وscANVI لبيانات RNA، وPeakVI وscBasset لإتاحة الكروماتين، وtotalVI وMultiVI للبيانات متعددة الوسائط، وDestVI وStereoscope لفك المزج المكاني. يعالج مباشرةً مشكلة عملية متكررة، إذ توجد بعض النماذج ضمن scvi.model وأخرى ضمن scvi.external، وتوضح الملفات المرجعية مساحة الأسماء الخاصة بكل نموذج. يعيد تحليل التعبير التفاضلي هنا مقدار عدم اليقين بدل قيمة p مجردة، وهذا هو السبب الرئيسي لاختياره بدل مسار Scanpy تقليدي.

التعليقات(0)

سجّل الدخول للتعليق

لا توجد تعليقات بعد، كن أول من يعلّق.

مهارات مشابهة

Acquire Codebase Knowledge

مهارة

يحوّل مستودعًا غير مألوف إلى سبع وثائق مدعومة بأدلة من الملفات

مسارات عمل البرمجة

pysam

مهارة

قراءة وكتابة ملفات BAM وCRAM وVCF في Python عبر HTSlib

قواعد البيانات والبياناتالأبحاث والعلوم

Statistical Power

مهارة

يحسب حجم العينة والأثر الأدنى القابل للكشف ومنحنيات القوة

قواعد البيانات والبياناتالأبحاث والعلوم